Eine zentrale Aufgabe ist die mikroskopische Begutachtung von Organ- und Gewebematerial, das Patienten des ukb bei diagnostischen oder therapeutischen Eingriffen entnommen wird. Dabei handelt es sich um 

• wenige Millimeter messende, bei endoskopischen Untersuchungen (z.B. aus dem Magen-Darm-Trakt) entnommene Proben (sog. Biopsate) 
• Punktionsmaterial aus nicht direkt zugänglichen Organen 
• Organe und Organteile (z.B. Lymphknoten, Gallenblase) 
• große Operationspräparate.

Nach der Fixierung mit Formalin erfolgen eine gründliche makroskopische Begutachtung und Beschreibung aller mit dem bloßen Auge wahrnehmbaren krankhaften Veränderungen. Kleinere Gewebe-proben werden im Ganzen bearbeitet, von großen Operationspräparaten werden repräsentative Proben entnommen. Tumoren werden exakt vermessen, die äußeren Grenzen des Präparates auf Tumorfreiheit überprüft. Mitentfernte Lymphknoten werden auf einen Tumorbefall untersucht. Auf diese Weise wird die Ausbreitung von Tumoren exakt dokumentiert, um genaue Informationen über das Stadium und die Prognose der Erkrankung zu erhalten.

Im Eingangslabor des Instituts werden von den entsprechenden Gewebeproben histologische Schnittpräparate angefertigt. Dazu muss das Gewebe in Automaten entwässert, paraffindurchtränkt und gehärtet werden, damit die medizinisch-technischen Assistentinnen (MTA) des Instituts wenige Mikrometer dünne Gewebeschnitte anfertigen können. Diese werden auf Glasobjektträger aufgebracht und stehen nach Anfärbung mit verschiedenen Verfahren für die mikroskopische Untersuchung durch die Fachärzte für Pathologie zur Verfügung.
 

Mit der Immunhistologie hat seit Anfang der 1980er Jahre die Immunologie Eingang in die pathologische Diagnostik gefunden. Der Einsatz von hochspezifischen Antikörpern gegen definierte Zielmoleküle erlaubt eine genaue Charakterisierung von Zellen und Geweben. Weiterhin können Zelleigenschaften ermittelt werden, die für die Prognose und für die weitere Therapie von Bedeutung sind. 

Die Immunhistologie ermöglicht es, einen Tumor exakt zu typisieren, seinen Ursprungsort einzugrenzen oder die zu erwartende Effektivität einer sich anschließenden Chemo- oder Strahlentherapie abzu-schätzen. 

Auch wichtige infektiöse Erreger lassen sich immunhistologisch nachweisen. In unserem Labor stehen etwa 140 Antikörper für die tägliche Diagnostik zur Verfügung. Durch eine Automatisierung der Im-munhistochemie wird eine hohe Standardisierung gewährleistet.
 

In jüngerer Zeit haben Techniken aus der Molekularbiologie Einzug in die pathologische Diagnostik gehalten. Durch die Korrelation von molekularbiologischen und histologischen Befunden können genetische Veränderungen definierten Zellen (z.B. Tumorzellen) zugeordnet werden. Wir bieten eine Reihe von molekularpathologischen Untersuchungen an. 

Hierzu gehört die in-situ-Hybridisierung zum Nachweis des HER2/NEU-Gens. Dieser Test hat bei Patientinnen mit Brustkrebs prognostische und therapeutische Relevanz. 

Weiterhin führen wir molekularpathologische Testverfahren zum Nachweis von Veränderungen (Mutationen) verschiedener Gene durch, die über die Therapie von Tumorpatienten mit neuen Medikamenten entscheiden. Das Spektrum der derzeit bei uns analysierten Veränderungen umfasst folgende Gene: HER2, EML4/ALK, KRAS, NRAS, EGFR, MGMT, und BRAF. Sie wirken sich u.a. auf die Behand-lungsmöglichkeiten bei Dickdarmkrebs und Lungenkrebs aus.

Auch verschiedene Virusinfektionen können bei uns molekularpathologisch nachgewiesen werden. Dazu gehören der Nachweis der Epstein-Barr Virus (EBV)-Infektion sowie Nachweis und Typisierung der Infektion mit Humanen Papillomviren (HPV).
 

Bei der Schnellschnittuntersuchung werden Gewebeproben während der laufenden Operation, d.h. intraoperativ, begutachtet. Damit in kürzester Zeit beurteilbare histologische Präparate vorliegen, wird das entnommene Gewebe tiefgefroren und dann mit einem sogenannten Kryostaten geschnitten.

Untersucht werden z.B. Befunde, bei denen während der Operation entschieden werden muss, ob ein Tumor vorliegt und ob dieser gut- oder bösartig ist. 

Durch die Untersuchung von Schnitträndern lässt sich intraoperativ bestimmen, ob ein Tumor vollständig entfernt wurde, oder ob eine Nachresektion erforderlich ist.  Das Ergebnis der Untersuchung liegt innerhalb von 15 bis 20 Minuten vor und entscheidet über das weitere Vorgehen des Operateurs.
 

Obduktionen (Autopsien, Sektionen) dienen der Aufklärung von Grunderkrankungen und Todesursachen. Sie stellen ein wichtiges Instrument der Qualitätssicherung in einem Krankenhaus dar. Die Ergebnisse der Obduktion dienen der Information von behandelnden Ärzten und Angehörigen, können aber auch versicherungsrechtlich von Bedeutung sein (z.B. für die Durchsetzung von Rentenansprüchen).

Wir führen klinische Obduktionen auf Anforderung der behandelnden Ärzte durch. Die Durchführung setzt die zu Lebzeiten gegebene Einwilligung des Verstorbenen oder die Zustimmung der nächsten Angehörigen voraus. Die Ergebnisse einer Obduktion werden in einer klinisch-pathologischen Konferenz erläutert und mit den behandelnden Ärzten besprochen. Die Obduktion dient damit auch der Aus- und Weiterbildung der Ärzte, nicht nur in der Pathologie, sondern auch in den klinischen Fächern. Aus den Krankheits- und Behandlungsverläufen lassen sich Lehren ziehen, die allen nachfolgenden Patienten zugutekommen („mortui vivos docent“ (lat.): die Toten lehren die Lebenden).